為全面打造無障礙友善環境，南院已規劃各項無障礙設施及參觀服務，如設置充足的身心障礙停車位、行動不便坡道、電梯、無障礙廁所、導盲定位磚與方向指引磚等；車上載有行動不便者，將引導該等自南北入口直接駛至最接近博物館入口處下車，以減少步行時間與距離。遊客中心除提供輪椅、嬰兒車免費租借外，由於南部日照期間長，另將提供免費傘具租借服務。期以全面友善的無障礙空間及觀眾服務，落實博物館藝文平權之理念。